Eturauhassyöpä: uusi indeksi ennustaa kasvaimen aggressiivisuutta

Vaikea päätöksenteko tarvittavaa hoitoa varten

Pelkästään Saksassa eturauhassyöpä diagnosoidaan vuosittain noin 60 000 miehelle. Tämän diagnoosin jälkeen monet ihmiset kohtaavat vaikean päätöksen: onko leikkaus tai sädehoito välttämätön vai riittääkö paikallisten kasvainten aktiivinen seuranta? Monille potilaille tämä on vaihtoehto invasiivisen hoidon joskus huomattavien sivuvaikutusten välttämiseksi.

Tutkijat analysoivat mutaatioprosesseja ja eturauhasen kasvainten kehittymistä

Varhaisimpien eturauhassyövän somaattisten muutosten havaitseminen voi antaa tärkeän käsityksen kasvaimen kehityksestä ja auttaa kerrostamaan syövät korkean ja matalan riskin mukaan.

Clarissa Gerhäuser ja kollegat DKFZ: sta yhdessä Kööpenhaminan yliopiston ja Euroopan molekyylibiologian laboratorion (EMBL), Hamburg-Eppendorfin yliopiston lääketieteellisen keskuksen, Max Planckin molekyyligenetiikan instituutin ja Berliinin Charitén yliopiston lääketieteen tutkijoiden kanssa analysoivat. koko genomi, transkripti ja 292 eturauhasen kasvaimen metylooma alkuvaiheessa. Kudosnäytteet olivat potilailta, joiden ikä oli ≤55 vuotta.

Varhaiset, jatkuvasti etenevät entsyymivälitteiset mutaatioprosessit

Tutkijat löysivät ikään liittyvät muutokset genomissa ja entsyymivälitteisen mutaatioprosessin, joka etenee ajan myötä, mikä edistää eturauhassyövän varhaisimpia mutaatioita. Mutaatioprosessin laukaavat oletettavasti APOBEC3-entsyymit. APOBEC-entsyymien ryhmä on osa nisäkkäiden synnynnäistä immuunijärjestelmää. Ne vahingoittavat tiettyjen virusten geneettistä koostumusta ja vähentävät siten niiden elinkelpoisuutta.

Toisaalta yliaktiiviset APOBEC-entsyymit on jo tunnistettu syövää edistävien mutaatioiden syyksi. "Oletamme, että APOBEC muuttaa eturauhassoluja hitaasti, mutta jatkuvasti jokaisen solujakauman yhteydessä. Joten ehkä 10–20 mutaatiota kerääntyy ehkä 20 vuoden aikana ”, kertoo tekijä Jan Korbel EMBL: stä.

Neljä molekyylialaryhmää, joilla on erilainen riskitaso

Käyttämällä epigeneettisiä markkereita Clarissa Gerhäuser kehitti "PEPCI" -epigeneettisen eturauhassyövän indeksin, joka mahdollistaa kasvaimen aggressiivisuuden helpon ennustamisen. Käyttämällä epigeneettisten markkereiden ja geeniekspressiomallien integroivaa analyysiä tutkijat tunnistivat neljä kasvainten molekyylialaryhmää, jotka eroavat taudin kulusta.

ESRP1-lokus: mahdollinen ennustemerkki

Erityisen aggressiivisessa, hyvin nopeasti jakautuvassa kasvainten alaryhmässä esiintyy ESRP1-geenin (epiteelin silmukointia säätelevä proteiini 1) kaksoiskappaleita ja lisääntynyttä ilmentymistä. Tutkijat vahvistivat tämän suhteen käyttämällä 12 000 kudosnäytettä. ESRP1-mutaatio on siksi lupaava ehdokas ennustemarkkerille, joka voidaan havaita syövän alkuvaiheessa.

DNA-sekvensointitiedot mahdollistavat kliinisen tuloksen ennustamisen

Tutkijat yhdistivät tiedot molekyylien ominaisuuksista ja ryhmäkohtaisesta taudin kehittymisriskistä tietokonemallissa. PRESCIENTiä toteutetaan parhaillaan kliinisen hoidon yhteydessä Berliinin Charitéssa. Tutkijat haluavat lisätä malliin useita tuhansia potilaita. Noin kahdesta kolmeen vuoteen malli voitaisiin toteuttaa kiinteänä osana kliinisiä prosesseja ja auttaa ennustamaan, kuinka eturauhassyöpä kehittyy tietyllä potilaalla.

!-- GDPR -->